發酵罐利用機械攪拌攪拌物料產生軸向和徑向流動，從而使罐內物料混合良好，液體中的固形物保持懸浮狀態，有利于固體和營養物質充分接觸，便于營養吸收；另一方面，可以打碎氣泡，增加氣液接觸面積，提高氣液間的傳質速率，加強氧的傳遞效果及消除泡沫。同時通入無菌空氣維持菌體氧氣需要，滿足好氧菌的生長發酵。

發酵罐的工作原理是利用浸在發酵液中的轉子迅速旋轉，導致液體和空氣在離心力的作用下向外邊緣運動，慢慢會導致轉子附近的壓力越來越大，所以發酵罐轉子的轉子變的更快了。由于轉子的空膛與大氣相通，發酵罐外的空氣通過過濾器不斷地被吸入，隨即甩向葉輪外緣，再通過異向葉輪使氣液均勻分布甩出。轉子的攪拌，又使氣液在葉輪周圍形成強烈的混合流，空氣泡被粉碎，氣液充分混合。